Biosurveillance
Dans le contexte de la biosécurité, la biosurveillance est la détection et la surveillance des agents biologiques afin de prévenir les menaces biologiques. Ceci est généralement réalisé via le séquençage métagénomique, la lecture de l’ensemble des acides nucléiques (ADN et ARN) présents dans un échantillon environnemental.
L’un des principaux exemples de biosurveillance est BioWatch, un programme fédéral américain conçu pour détecter la dissémination d’agents pathogènes connus dans 21 villes américaines. Il se concentre principalement sur la détection des rejets dans l’air et sur les tests PCR subséquents par rapport à une liste de pathogènes candidats. BioWatch a toutefois été critiqué parce qu’il échouait à répondre à des menaces connues et qu’il déclenchait des faux positifs.
L’Observatoire des Acides Nucléiques (Nucleic Acid Observatory) est une proposition non biaisée, basée sur le séquençage métagénomique. Il vise à détecter tout changement dans la présence et la composition des acides nucléiques dans les principaux cours d’eau et les eaux usées, afin de reconnaître le plus tôt possible les nouveaux agents pathogènes.
Ben Fox (2021) Audit finds major gaps in US bio weapons detection system, AP News, 4 mars.
David F. Nieuwenhuijse et al. (2020) Setting a baseline for global urban virome surveillance in sewage, Scientific Reports, vol. 10, 13748.
.
The Nucleic Acid Observatory Consortium (2021) A global nucleic acid observatory for biodefense and planetary health, arXiv:2108.02678.